Anime School Animal Simulator é um jogo de ação anime 3D com elementos de yandere e RPG, ambientado em uma escola. A personagem principal, Ayano, é uma típica personagem yandere que chega à escola apenas para descobrir que, em vez de alunos normais, se depara com animais mutantes. Esses mutantes já foram seus colegas de classe, e agora ela deve combatê-los, explorar a escola, descobrir segredos e encontrar uma maneira de devolver seus amigos às suas formas normais.
Ayano não deve apenas lutar contra os mutantes, mas também salvar seus amigos de serem ainda mais infectados e encontrar uma maneira de impedir a propagação da mutação. Ao longo do jogo, ela irá desvendar o mistério por trás dos mutantes e procurar uma solução para impedir esse fenômeno aterrorizante. O jogo apresenta 15 níveis, cada um repleto de ação, quebra-cabeças e batalhas contra chefes.
Os jogadores precisarão comprar armas e roupas, que proporcionam proteção e melhoram as habilidades de Ayano, ajudando-a a sobreviver nesta situação perigosa. Roupas e armas são cruciais nas batalhas contra mutantes e chefes poderosos. O jogo também inclui elementos de exploração, onde Ayano deve vasculhar diferentes partes da escola para encontrar pistas e soluções para o problema.
Ayano também conhece seu amor, Taro, e seus sentimentos por ele se tornam mais intensos e perigosos, adicionando elementos yandere ao enredo. Ao longo do jogo, Ayano lutará contra suas emoções e apego a Taro, pois seu amor por ele pode se tornar uma ameaça não apenas para ela, mas também para aqueles ao seu redor.
Anime School Animal Simulator combina elementos de anime, yandere, simulação escolar e RPG, oferecendo aos jogadores uma história única onde eles não apenas lutam contra mutantes e descobrem segredos, mas também tentam salvar seus amigos e impedir a propagação de uma infecção destrutiva.